この文章を書いているtdiaryはnginxとphp-fpmとpassengerで動かしているのだけれど、久々にgem updateとかtdiary updateとかしてたら動かなくなった（笑）
nginxのerror.logを見ると、
/usr/lib/ruby/2.5.0/fileutils.rb:90: warning: already initialized constant FileUtils::VERSION
やら
/usr/lib/ruby/vendor_ruby/did_you_mean/version.rb:2: warning: already initialized constant DidYouMean::VERSION
やらが出ている。ので、例えばdid_you_meanの方は
gem uninstall did_you_mean
gem update --default
としたら直った。こちらの記事を参考に。というかそのまんま。